(一)海洋相關政策及議題之研究。
(二)辦理學術研討會、論壇、座談、演講等活動。
(三)舉辦海洋文化藝術、體育、觀光交流活動。
(四)推動各類海內外海洋課程。
(五)辦理海洋師資培訓與認證課程。
(六)舉辦國際海洋學術交流考察活動，並與各國海洋機構進行學術交流及師生互訪。
(七)協助政府辦理海洋教育，編纂海內外海洋教材，培訓海洋教育師資。
(八)接受政府機關、學校、國內外公私立機構與團體之委託，舉辦海洋教育訓練與相關進修課程。
(九)其他與海洋研究、教學或交流活動之相關業務。

中心之業務主要可分為「研究」、「教學」、「圖書收藏」、「學術活動」與「出版」等五方面。